Giáo trình Enzyme học

Nội dung "Giáo trình Enzyme học" trình bày định nghĩa về enzyme, phương pháp nghiên cứu enzyme, cách gọi tên và phân loại enzyme, cấu trúc phân tử enzyme, tính đặc hiệu của enzyme và cơ chế tác dụng của enzyme. Mời các bạn tham khảo!
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Giáo trình Enzyme học 4 Mục lục Trang Lời nói đầu 3 Chương 1 Mở đầu 7 1.1. Định nghĩa enzyme 7 1.2. Lược sử nghiên cứu enzyme 7 1.2.1. Giai đoạn 1 7 1.2.2. Giai đoạn 2 8 1.2.3. Giai đoạn 3 9 1.2.4. Giai đoạn 4 12 1.3. Phương hướng nghiên cứu enzyme 14 1.4. Những vấn đề cần đề cập khi nghiên cứu enzyme 16 1.5. Vấn đề nghiên cứu enzyme ở nước ta 17 Tài liệu tham khảo 18 Chương 2 Phương pháp nghiên cứu enzyme 19 2.1. Những nguyên tắc chung khi nghiên cứu enzyme 19 2.2. Tách và làm sạch (tinh chế) enzyme 21 2.2.1. Chọn nguồn nguyên liệu 21 2.2.2. Chiết rút enzyme 26 2.2.3. Các phương pháp tách từng phần protein enzyme 28 2.2.4. Kết tinh protein enzyme 38 2.2.5. Đánh giá tính đồng thể của protein enzyme 39 Hoạt độ enzyme 41 2.3.1. Phương pháp xác định hoạt độ enzyme 41 2.3.2. Đơn vị hoạt độ enzyme 41 2.3. Tài liệu tham khảo 4 43 Chương 3 Cách gọi tên và phân loại enzyme 44 3.1. Cách gọi tên enzyme 44 3.2. Phân loại enzyme 44 5 3.2.1. Các lớp enzyme 44 3.2.2. Các phản ứng enzyme 46 Tài liệu tham khảo 51 Chương 4 Cấu trúc phân tử enzyme 52 4.1. Bản chất hóa học của enzyme 52 4.2. Thành phần cấu tạo của enzyme 53 4.3. Cấu trúc bậc 4 của enzyme 54 4.4. Trung tâm hoạt động của enzyme 56 4.5. Phương pháp thăm dò và phát hiện các nhóm chức năng trong trung tâm hoạt động của enzyme 57 4.5.1. Phương pháp dùng chất ức chế 58 4.5.2. Phương pháp đánh dấu bằng cơ chất đặc hiệu hoặc coenzyme 59 4.5.3. Xác định trị số pK của các nhóm hoạt động 60 4.5.4. Nghiên cứu cấu trúc phân tử 60 4.6. Các dạng phân tử của enzyme 61 4.7. Phức hợp multienzyme 62 Tài liệu tham khảo 63 Chương 5 Tính đặc hiệu của enzyme 64 5.1. Khái niệm chung 64 5.2. Các hình thức đặc hiệu 64 5.2.1. Đặc hiệu kiểu phản ứng 64 5.2.2. Đặc hiệu cơ chất 64 Tài liệu tham khảo 68 Chương 6 Cơ chế tác dụng của enzyme 69 6.1. Cơ chế của phản ứng có xúc tác nói chung 69 6.2. Cơ chế của xúc tác enzyme 69 Tài liệu tham khảo 73 6 Chương 7 Động học Enzyme 74 7.1. Ý nghĩa của việc nghiên cứu động học enzyme 74 7.2. Động học các phản ứng enzyme 74 74 7.2.2. Ảnh hưởng của nồng độ enzyme Ảnh hưởng của nồng độ cơ chất [S] 7.2.3. Ảnh hưởng của chất kìm hãm (inhibitior) 79 7.2.4. Ảnh hưởng của chất hoạt hóa (activator) 9 7.2.5. 87 7.2.6. Ảnh hưởng của nhiệt độ Ảnh hưởng của pH 7.2.7 Các yếu tố khác 89 Tài liệu tham khảo 91 Chương 8 Sinh học enzyme 92 8.1 Sự phân bố enzyme trong tế bào 92 8.2 Điều hòa hoạt độ và số lượng của enzyme trong tế bào 94 8.2.1 Điều hòa hoạt độ enzyme 94 8.2.2 Điều hòa sinh tổng hợp enzyme 101 Tài liệu tham khảo 108 Chương 9 Công nghệ enzyme và ứng dụng 109 9.1. Công nghệ enzyme 109 9.1.1. Enzyme với công nghệ sinh học 109 9.1.2. Công nghệ sản xuất enzyme 109 Ứng dụng 111 9.2.1. Ứng dụng trong y dược 111 9.2.2. Ứng dụng trong hóa học 112 9.2.3. Ứng dụng trong công nghiệp 113 Tài liệu tham khảo 116 7.2.1. 9.2. 75 88 7 Chương 1 Mở đầu 1.1. Định nghĩa enzyme Trong cơ thể sống (các tế bào) luôn luôn xảy ra quá trình trao đổi chất. Sự trao đổi chất ngừng thì sự sống không còn tồn tại. Quá trình trao đổi của một chất là tập hợp các quy luật của rất nhiều các phản ứng hóa học khác nhau. Các phản ứng hóa học phức tạp này có liên quan chặt chẽ với nhau và điều chỉnh lẫn nhau. Enzyme là các hợp chất protein xúc tác cho các phản ứng hóa học đó. Chúng có khả năng xúc tác đặc hiệu các phản ứng hóa học nhất định và đảm bảo cho các phản ứng xảy ra theo một chiều hướng nhất định với tốc độ nhịp nhàng trong cơ thể sống. Chúng có trong hầu hết các loại tế bào của cơ thể sống. Chính do những tác nhân xúc tác có nguồn gốc sinh học nên enzyme còn được gọi là các chất xúc tác sinh học (biocatalysators) nhằm để phân biệt với các chất xúc tác hóa học. Enzyme học là khoa học nghiên cứu những chất xúc tác sinh học có bản chất protein. Hay nói cách khác, enzyme học là khoa học nghiên cứu những tính chất chung, điều kiện, cơ chế tác dụng và tính đặc hiệu của các enzyme. 1.2. Lược sử nghiên cứu enzyme Do enzyme học được coi như cột sống của hóa sinh học nên phần lớn các nghiên cứu hóa sinh từ trước đến nay đều liên quan nhiều đến enzyme. Về sự phát triển của học thuyết enzyme, có thể chia thành 4 giai đoạn: - Giai đoạn 1: trước thế kỷ thứ XVII - Giai đoạn 2: từ thế kỷ XVII đến nửa đầu thế kỷ XIX - Giai đoạn 3: từ giữa thế kỷ XIX đến 30 năm đầu của thế kỷ XX - Giai đoạn 4: từ những năm 30 của thế kỷ XX đến nay. 1.2.1. Giai đoạn 1 Trước thế kỷ XVII người ta đã biết sử dụng các quá trình enzyme trong đời sống song chỉ có tính chất kinh nghiệm thực tế và thông qua hoạt động của vi sinh vật. Đó là các quá trình lên men rượu, muối dưa, làm tương và nước chấm... Ở thời kỳ này người ta chưa hiểu về bản chất enzyme và các quá trình lên men. 8 1.2.2. Giai đoạn 2 Ở giai đoạn này các nhà bác học đã tiến hành tìm hiểu bản chất của các quá trình lên men. Thời kỳ này đã khái quát hiện tượng lên men như là hiện tượng phổ biến trong sự sống và enzyme là yếu tố gây nên sự chuyển hóa các chất trong quá trình lên men. Vào những năm 1600 của thế kỷ XVII, Van Helmont là người đầu tiên cố gắng đi sâu tìm hiểu bản chất của quá trình lên men. Van Helmont đã nhận thấy thực chất của sự tiêu hóa là sự chuyển hóa hóa học của thức ăn và giải thích cơ chế của nó với sự so sánh nó với quá trình lên men rượu. Danh từ ferment (từ chữ Latinh fermentatio - sự lên men) được Van Helmont dùng để chỉ tác nhân gây ra sự chuyển biến các chất trong quá trình lên men rượu. Vào nửa cuối thế kỷ thứ XVIII, nhà tự nhiên học người Pháp là Réaumur cũng đã nghiên cứu bản chất của sự tiêu hóa. Nhà tự nhiên học này đã cho chim quạ đen nuốt những miếng thịt đặt sẵn trong ống kim loại có thành đã được đục sẵn và buộc vào dây thép. Sau vài giờ đã không thấy gì ở trong ống. Hiện tượng này đã thúc đẩy sự nghiên cứu thành phần dịch tiêu hóa để tìm hiểu k ...