Phân tích tần số gen kháng kháng sinh ở Salmonella và sàng lọc hợp ức chế kháng kháng sinh tiềm năng bằng công cụ sàng lọc ảo

Bài viết Phân tích tần số gen kháng kháng sinh ở Salmonella và sàng lọc hợp ức chế kháng kháng sinh tiềm năng bằng công cụ sàng lọc ảo được nghiên cứu nhằm xác định tần suất xuất hiện của gen kháng kháng sinh trong hệ gen Salmonella có nguồn gốc phân lập ở Việt Nam và sàng lọc các hợp chất có khả năng ức chế kháng kháng sinh.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Phân tích tần số gen kháng kháng sinh ở Salmonella và sàng lọc hợp ức chế kháng kháng sinh tiềm năng bằng công cụ sàng lọc ảo TNU Journal of Science and Technology 228(01): 83 - 91ANALYZING THE FREQUENCY OF ANTIMICROBIAL RESISTANCE GENEIN SALMONELLA AND DETERMINING POTENTIAL INHIBITORS OFANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN BY VIRTUAL SCREENINGTa Ngoc Ly*, Dinh Thi HoaiDa nang University of Technology and Science - University of Da nang ARTICLE INFO ABSTRACT Received: 09/8/2022 Antimicrobial resistance is a global public health concern. Salmonella is one of the microorganisms in which some resistant serotypes have Revised: 19/10/2022 emerged, affecting the food chain. Therefore, research to find new Published: 21/10/2022 compounds with potential to inhibit antibiotic resistance Salmonella is urgently needed. This study aims to determine the frequency ofKEYWORDS antibiotic resistance genes appearing in the Salmonella genome isolated in Vietnam and to screen compounds with potential inhibitingAAC(6) - Iaa antibiotic resistance related protein. Using bioinformatics tools, theAntimicrobial resistance analysis results showed that the AAC(6)-Iaa gene has the highestFrequency frequency in the studied samples. For virtual screening of bioactive compounds with potential to inhibit antibiotic resistance, molecularSalmonella docking and pharmacokinetic properties prediction methods are used.Virtual screening The results of the screening process found 4 most potential compounds including KU-0058684, AdipoRon, BPIPP và CID 3447933. These compounds have high affinity to target proteins, suitable pharmacokinetic properties for drug formulation, and can be used as leading compounds in further drug development studies.PHÂN TÍCH TẦN SỐ GEN KHÁNG KHÁNG SINH Ở SALMONELLAVÀ SÀNG LỌC HỢP ỨC CHẾ KHÁNG KHÁNG SINH TIỀM NĂNGBẰNG CÔNG CỤ SÀNG LỌC ẢOTạ Ngọc Ly*, Đinh Thị HoàiTrường Đại học Bách khoa - ĐH Đà Nẵng THÔNG TIN BÀI BÁO TÓM TẮT Ngày nhận bài: 09/8/2022 Kháng kháng sinh là một mối quan tâm sức khỏe cộng đồng toàn cầu. Salmonella là một trong những vi sinh vật mà một số chủng huyết Ngày hoàn thiện: 19/10/2022 thanh kháng thuốc đã xuất hiện, ảnh hưởng đến chuỗi thức ăn. Do đó, Ngày đăng: 21/10/2022 nghiên cứu tìm ra các hợp chất mới có tiềm năng ức chế kháng kháng sinh là hết sức cần thiết. Nghiên cứu này nhằm xác định tần suất xuấtTỪ KHÓA hiện của gen kháng kháng sinh trong hệ gen Salmonella có nguồn gốc phân lập ở Việt Nam và sàng lọc các hợp chất có khả năng ứcAAC(6) - Iaa chế kháng kháng sinh. Sử dụng công cụ tin sinh học, kết quả phânKháng kháng sinh tích cho thấy gen AAC(6) - Iaa có tần số xuất hiện cao nhất trong cácTần suất mẫu nghiên cứu. Để sàng lọc ảo các hợp chất có hoạt tính sinh học có khả năng ức chế gen kháng kháng sinh này, các phương pháp lắp rápSalmonella phân tử và dự đoán đặc tính dược động học được sử dụng. Kết quảSàng lọc ảo của quá trình sàng lọc đã tìm ra 4 hợp chất tiềm năng nhất bao gồm KU-0058684, AdipoRon, BPIPP và CID 3447933. Các hợp chất này có ái lực cao với protein đích, tính chất dược động học phù hợp để chế tạo thành thuốc, có thể được sử dụng làm hợp chất hàng đầu trong các nghiên cứu phát triển thuốc tiếp theo.DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.6344* Corresponding author. Email: tnly@dut.udn.vnhttp://jst.tnu.edu.vn 83 Email: jst@tnu.edu.vn TNU Journal of Science and Technology 228(01): 83 - 911. Giới thiệu Kháng sinh đóng một vai trò quan trọng trong giảm tỷ lệ mắc bệnh và tử vong do các bệnhnhiễm khuẩn. Tuy nhiên, việc sử dụng kháng sinh cho người và động vật thường xuyên và quá mứcgây ra các vấn đề sức khỏe lớn, bao gồm sự hiện diện của dư lượng kháng sinh trong mô cơ thể vàcác sản phẩm ch ...