Ứng dụng phương pháp SSR (Simple Sequence Repeats) trong chọn tạo các dòng lúa thơm

Bài viết Ứng dụng phương pháp SSR (Simple Sequence Repeats) trong chọn tạo các dòng lúa thơm trình bày xác định tình trạng mùi thơm bằng dấu chuẩn phân tử của bốn đoạn mồi ESP, IFAP, INSP, EAP thông qua kỹ thuật PCR.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Ứng dụng phương pháp SSR (Simple Sequence Repeats) trong chọn tạo các dòng lúa thơm T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP SSR (SIMPLE SEQUENCE REPEATS) TRONG CHỌN TẠO CÁC DÒNG LÚA THƠM Trần Vũ Hải, Vũ Minh Thuận, Nguyễn Lê Vân, Nguyễn Thị Phương Thơ, Phạm Ngọc Tú SUMMARY Applications in SSR (Simple Sequence Repeats) method for aromatic gene rice breedingGene BAD2 with homology to the gene that encodes betaine aldehyde dehydrogenase (BAD) hassignificant polymorphisms in the coding region of fragrant genotypes relative to non-fragrantgenotypes. Here, we show that the evaluation of the aroma of rice by analyzed SSR has greatsignificance in determining the line/aromatic rice varieties for planting serves fragrant rice varieties,good quality later. Through molecular markers will soon aid selection in a rice breeding program.To determine the aroma, we were selected 40 crossed including backcross crossed (BC1F3,BC2F3), single-cross and double-cross from aromatic rice varieties. Analysis based on four markersspecific primer ESP, IFAP, INSP and EAP, the results show that: SSR analysis of 198 plants from40 crossed showed 10 crossed in homozygous for aroma gene and 30 crossed combinations forthe genotypes aromatic and non-aromatic. The rate in homozygous for aroma gene in the samecrossed was ranged 40% -100%.Keywords: Rice, aromatic gene, aromatic rice, SSR (simple sequence repeats)I. ĐẶT VẤN ĐỀ dị hợp tử. Đỗ Thị Thu Hương dùng 2 cặp mồi ASA để phân tích 42 dòng Để có thể đáp ứng được yêu cầu xuất giống lúa ở Vi t Nam, trong đó có 16khẩu gạo, vi c chọn lọc các giống lúa thơm lúa thơm đồng hợp tử và 26 dòng lúa khôngchất lượng cao là một trong những nhu cầu thơm đồng hợp tử. Nguyễn Thị Langcấp bách hi n nay ở nư c ta. Chiến lược tạo ) nghiên cứu mùi thơm trên quần thểgiống lúa thơm cần được quan tâm hơn của 4 t hợp lai cho kết quả h số ditrong phương hư ng cải tiến giống lúa ở truyền rất thấp, chứng tỏ rằng tính trạngnhững vùng trồng lúa chất lượng cao. Vì vậy mùi thơm tương tác v i môi trường rất cao.vi c duy trì mùi thơm thông qua quá trình lai n cứu này đã xác định được tínhhồi giao, từ đó đánh giá mùi thơm bằng trạng mùi thơm của 40 t hợp lai hồi giaophương pháp dấu chuẩn phân tử là cần thiết. lúa thơm ở thế h BC , t hợp lai Di truyền tính trạng thơm ở lúa đã được đơn và lai đôi thông qua phương pháp phânnhiều nhà khoa học quan tâm nghiên cứu. tích dấu chuẩn phân tử nhờ kỹ thuật SSR. II. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨUGen điều khiển tính trạng mùi thơm đượcghi nhận ở nhiều tác giả khác nhau, v inhiều kết luận khác nhau mùi thơm do đa gen điều 1. Vật liệu nghiên cứukhiển Bradbury và ctv (2005) đãcứu về cấu trúc, chức năng gen tạo mùi 40 t hợp lai, trong đó có 12 t hợp laithơm trên cây lúa, sử dụng kỹ thuật ASA hồi giao ở thế h BC , 14 t hợp lai hồi(Allele specific amplification) v i phản ứng giao ở thế h BC , còn lại 14 t hợp laiPCR để phân bi t gen thơm đồng hợp tử và đơn và lai đôi v i ít nhất 1 gống lúa thơm ởT¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Namcác thế h từ F đến F , các t hợp được lai 2. Phương pháp nghiên cứutạo tại Vi n Lúa đồng bằng sông Cửu Long Phân tích mùi thơm bằng đánh giá kiểu ĐBSCL , giống đối chứng thơm: ông qua phân tích SSR v i 4 đoạn mồi đặc hi u (ESP; INSP; IFAP; EAP) ở bảng 2 để kiểm tra gen BAD2 nằm trên Bảng 1. Danh sách t hợp lai sử dụng nhiễm sắc thể số 8, mã hóa cho betatain trong thí nghi m aldehyde dehydrogenase 2 quy định tính Tên Ghi thơm của lúa do Bradbury và ctv. đã côngSTT Tên dòng Ghi chú STT dòng chú bố năm 2005. 1 SH1169 BC2F3 21 SH1764 F3 2 SH1170 BC2F3 22 SH1765 BC2F3 c giống/dòng lúa thơm phân tích và 3 SH1172 BC2F3 23 SH1766 BC1F3 giống lúa đối chứng được trồng trong nhà lư i, khi đạt ...