Đa hình thái đơn nucleotide RS1049174 của gen NKG2D trên bệnh nhân u lympho

Mục tiêu nghiên cứu nhằm xác định sự phân bố của đa hình đơn này trong nhóm u lympho so với đối tượng khỏe mạnh. 129 bệnh nhân mắc u lympho và 178 người khỏe mạnh được thu thập mẫu máu. Sử dụng kỹ thuật PCR – RFLP và Real – time PCR để phân tích sự biến đổi đa hình này.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Đa hình thái đơn nucleotide RS1049174 của gen NKG2D trên bệnh nhân u lympho TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC ĐA HÌNH THÁI ĐƠN NUCLEOTIDE RS1049174 CỦA GEN NKG2D TRÊN BỆNH NHÂN U LYMPHO Nguyễn Thị Hồng Minh¹, Vũ Thị Lan¹, Vũ Hồng Nhung², Nguyễn Tuấn Tùng³ và Nguyễn Hoàng Việt1,  1 Trường Đại học Y Hà Nội, 2Trường Đại học Khoa học Tự nhiên – ĐHQGHN, 3 Trung tâm Huyết học và Truyền máu – Bệnh viện Bạch Mai. NKG2D là một thụ thể quan trọng nhất trên bề mặt tế bào NK, đóng vai trò trong việc tiêu diệt tế bào nhiễmvirus và ung thư nhờ sự tiếp hợp với những phối tử đặc hiệu trên bề mặt tế bào đích. Nghiên cứu trước đã chứngminh vai trò của đa hình đơn rs1049174 tại vị trí 3’UTR của gen NKG2D trong các dạng ung thư nhiễm HPV.Mục tiêu nghiên cứu nhằm xác định sự phân bố của đa hình đơn này trong nhóm u lympho so với đối tượngkhỏe mạnh. 129 bệnh nhân mắc u lympho và 178 người khỏe mạnh được thu thập mẫu máu. Sử dụng kỹ thuậtPCR – RFLP và Real – time PCR để phân tích sự biến đổi đa hình này. Dạng alen G so với alen C: OR = 0,67;95% CI: 0,48 – 0,93. Kiểu gen GG so với GC + CC: OR = 0,56; 95% CI: 0,34 – 0,94. Alen G và kiểu gen GG củaSNP rs1049174 liên quan đến sự giảm nguy cơ u lympho nhưng không liên quan đến nguy cơ NHL và DLBCL.Từ khóa: U lympho, đa hình đơn rs1049174G, gen NKG2DI. ĐẶT VẤN ĐỀ Năm 2018, có khoảng 590 nghìn ca u ca mới mắc u lympho, 2476 người tử vong dolympho mắc mới (chiếm 3,2% tổng các trường bệnh này và con số này đang có xu hướng giahợp ung thư). Trong đó tỷ lệ mới mắc u lympho tăng. Nguyên nhân của u lympho bao gồm cáckhông Hodgkin (NHL) cao gấp 6,4 lần u lympho tác nhân truyền nhiễm, suy giảm miễn dịch,Hodgkin (HL), là nguyên nhân thứ mười một bệnh tự miễn, yếu tố di truyền, tiếp xúc với mộtgây tử vong do ung thư và là bệnh ung thư số hóa chất hữu cơ và dược phẩm.phổ biến thứ chín trên toàn thế giới.1 U lympho Phân tử NKG2D là một protein xuyên màngthường phổ biến hơn ở các nước phát triển và ít typ II họ lectin, mang cả hai chức năng là thụphổ biến hơn ở các nước đang phát triển. Tỷ lệ thể hoạt hoá của tế bào NK và đồng kích thíchmắc bệnh u lympho nói chung ở các nước châu của tế bào T CD8+, được biểu hiện trên tế bàoÁ là tương đối thấp.2,3,4 U lympho Hodgkin đã NK và tế bào γϭT cũng như tế bào T CD8+.5được báo cáo là hiếm ở các nước châu Á.4 Tuy Liên kết của thụ thể NKG2D trên tế bào NK vớinhiên, tỷ lệ mắc u lympho không Hodgkin trên phối tử của nó sẽ kích hoạt quá trình sản xuấttoàn thế giới đang tăng lên. Các nước Đông Á các yếu tố gây độc qua trung gian tế bào vàhiện nay cũng có tỷ lệ mắc ngày càng tăng.3 đồng thời kích thích sản xuất các cytokine dùỞ Việt Nam, theo thống kê của Tổ chức Ung cho tế bào đích có biểu hiện HLA lớp I bìnhthư toàn cầu GLOBOCAN năm 2018 có 4239 thường hay không, từ đó tiêu diệt tế bào nhiễm vi rút và các khối u.6 Đa hình rs1049174 G > CTác giả liên hệ: Nguyễn Hoàng Việt, nằm ở vùng 3′ không mã hóa (3′UTR) của genTrường Đại học Y Hà Nội NKG2D, các haplotype của nó có liên quan đếnEmail: hoangviet@hmu.edu.vn hoạt động cao của tế bào NK (HNK) hoặc hoạtNgày nhận: 14/12/2019 động thấp (LNK). Kiểu hình HNK được thấyNgày được chấp nhận: 17/03/202016 TCNCYH 126 (2) - 2020 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌCtrong các cá thể mang alen rs1049174 G, trong QIAGEN, sau đó xác định kiểu gen sử dụngkhi đó LNK được thấy trong các cá thể mang kỹ thuật Real – time PCR Genotyping: Phaalen C.7 Do đó, biểu hiện của NKG2D có thể có loãng DNA để được nồng độ khoảng 20 ng/µl.những tác động khác biệt trong sự nhạy cảm Thành phần phản ứng Real – time PCR (thểđối với các dạng ung thư dòng lympho. tích 10 µl) bao gồm: 5 µl Taqman Genotyping Mục đích của nghiên cứu này là tìm hiểu Master Mix (cung cấp bởi Thermoscientific,mối liên quan giữa đa hình rs1049174 của gen 4371353); 0,5 µl 20x Probe primers (cung cấpNKG2D và nguy cơ mắc u lympho ở bệnh nhân bởi Thermoscientific, C_9345347_10); 4,5Việt Nam. µl DNA đã pha loãng. Sau đó thực hiện phản ứng Real – time PCR trên máy QuantStudio3II. ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP được cung cấp bởi Applied Biosystems với chu1. Đối tượng trình nhiệt bao gồm: 60ºC/30 giây, 95 ºC/10 Đối tượng nghiên cứu gồm 129 bệnh nhân phút, [95ºC/15 giây, 60ºC/ 1 phút] x 40 chu kỳđáp ứng tiêu chuẩn lựa chọn được chẩn đoán và dừng phản ứng tại 60 ºC/30 giây. Phản ứngxác định giải phẫu bệnh là u lympho chung bao sử dụng 2 kênh tín hiệu là VIC/FAM tương ứnggồm u lympho Hodgkin và u lympho không với 2 nucleotide C và G. Khi thu được chỉ tínHodgkin (NHL) tại Viện Huyết học – Truyền hiệu VIC – kiểu gen tương ứng là CC, chỉ tínmáu Trung ương và Bệnh viện Bạch Mai. Trong hiệu FAM - GG, cả 2 tín hiệu VIC/FAM – GC.đó có 112 bệnh nhân mắc NHL, trong số này ...